Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pak1ip1Q9DCE5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pak1ip1Q9DCE5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pak1ip1Q9DCE5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms