Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alkbh4Q9D8F1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Alkbh4Q9D8F1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alkbh4Q9D8F1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms