Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl4Q9D8E6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl4Q9D8E6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl4Q9D8E6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms