Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Klhl40Q9D783 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klhl40Q9D783 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms