Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fsip1Q9D3V5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fsip1Q9D3V5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms