Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spns3Q9D232 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Spns3Q9D232 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spns3Q9D232 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms