Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prkrip1Q9CWV6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Prkrip1Q9CWV6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms