Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc96Q9CR92 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc96Q9CR92 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc96Q9CR92 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms