Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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