Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim11Q99PQ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms