Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN0

Slc5a5, Sodium/iodide cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a5Q99PN0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc5a5Q99PN0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc5a5Q99PN0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc5a5Q99PN0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 337.1 ms