Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rrbp1Q99PL5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Rrbp1Q99PL5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rrbp1Q99PL5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.4 ms