Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH0

Ankrd17, Ankyrin repeat domain-containing protein 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd17Q99NH0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ankrd17Q99NH0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ankrd17Q99NH0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms