Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtpbp4Q99ME9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtpbp4Q99ME9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtpbp4Q99ME9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms