Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsl24d1Q99L28 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsl24d1Q99L28 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsl24d1Q99L28 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms