Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlgn1Q99K10 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nlgn1Q99K10 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nlgn1Q99K10 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms