Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ophn1Q99J31 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ophn1Q99J31 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ophn1Q99J31 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms