Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sntg1Q925E1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sntg1Q925E1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sntg1Q925E1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms