Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cts3Q91ZD5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cts3Q91ZD5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms