Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk8Q8R3L8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk8Q8R3L8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk8Q8R3L8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.2 ms