Protein–RNA interactions for Protein: Q8K368

Fanci, Fanconi anemia group I protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanciQ8K368 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanciQ8K368 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FanciQ8K368 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanciQ8K368 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms