Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shtn1Q8K2Q9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shtn1Q8K2Q9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shtn1Q8K2Q9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms