Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spire2Q8K1S6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spire2Q8K1S6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Spire2Q8K1S6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spire2Q8K1S6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms