Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700001C19RikQ8K168 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001C19RikQ8K168 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001C19RikQ8K168 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms