Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8W7

A930004D18Rik, MCG147224, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930004D18RikQ8C8W7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
A930004D18RikQ8C8W7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A930004D18RikQ8C8W7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 463.5 ms