Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Npm2Q80W85 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Npm2Q80W85 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Npm2Q80W85 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Npm2Q80W85 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Npm2Q80W85 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms