Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pnma8aQ80VM8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnma8aQ80VM8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pnma8aQ80VM8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnma8aQ80VM8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnma8aQ80VM8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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