Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SynmQ70IV5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SynmQ70IV5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SynmQ70IV5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
SynmQ70IV5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms