Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cnot1Q6ZQ08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot1Q6ZQ08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot1Q6ZQ08 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms