Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fndc3bQ6NWW9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fndc3bQ6NWW9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc3bQ6NWW9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms