Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn11Q6J756 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn11Q6J756 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms