Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rftn1Q6A0D4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rftn1Q6A0D4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms