Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg9aQ68FE2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg9aQ68FE2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg9aQ68FE2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms