Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Knl1Q66JQ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Knl1Q66JQ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Knl1Q66JQ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Knl1Q66JQ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms