Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou4f3Q63955 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pou4f3Q63955 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pou4f3Q63955 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms