Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zic3Q62521 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zic3Q62521 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms