Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tns3Q5SSZ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tns3Q5SSZ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tns3Q5SSZ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tns3Q5SSZ5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tns3Q5SSZ5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tns3Q5SSZ5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tns3Q5SSZ5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tns3Q5SSZ5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tns3Q5SSZ5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms