Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmtc2Q56A06 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmtc2Q56A06 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmtc2Q56A06 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms