Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otol1Q4ZJM7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otol1Q4ZJM7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms