Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpf38aQ4FK66 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf38aQ4FK66 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf38aQ4FK66 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms