Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc9a2Q3ZAS0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9a2Q3ZAS0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a2Q3ZAS0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms