Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pydc3Q3V3Q4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pydc3Q3V3Q4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pydc3Q3V3Q4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pydc3Q3V3Q4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pydc3Q3V3Q4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pydc3Q3V3Q4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pydc3Q3V3Q4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pydc3Q3V3Q4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pydc3Q3V3Q4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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