Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
4930567H17RikQ3V0K5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930567H17RikQ3V0K5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930567H17RikQ3V0K5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms