Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms