Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zscan4fQ3URS2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4fQ3URS2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms