Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nkain3Q3URJ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nkain3Q3URJ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms