Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acsf3Q3URE1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acsf3Q3URE1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acsf3Q3URE1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms