Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lmod2Q3UHZ5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lmod2Q3UHZ5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lmod2Q3UHZ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms