Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkx6-3Q3UHX8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Nkx6-3Q3UHX8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Nkx6-3Q3UHX8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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