Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srebf2Q3U1N2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srebf2Q3U1N2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srebf2Q3U1N2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms